Evaluation of two interaction techniques for visualization of dynamic graphs

Several techniques for visualization of dynamic graphs are based on different spatial arrangements of a temporal sequence of node-link diagrams. Many studies in the literature have investigated the importance of maintaining the user's mental map across this temporal sequence, but usually each layout is considered as a static graph drawing and the effect of user interaction is disregarded. We conducted a task-based controlled experiment to assess the effectiveness of two basic interaction techniques: the adjustment of the layout stability and the highlighting of adjacent nodes and edges. We found that generally both interaction techniques increase accuracy, sometimes at the cost of longer completion times, and that the highlighting outclasses the stability adjustment for many tasks except the most complex ones.Comment: Appears in the Proceedings of the 24th International Symposium on Graph Drawing and Network Visualization (GD 2016

An Interactive Approach for Exploration of Flows Through Direction-Based Filtering

This paper is concerned with the representation and exploration of flows, defined as spatial interactions between geographic locations. Flows are challenging to display in a comprehensible manner due to the nature of the data, which are characterized by many crossings and overlaps leading to clutter. A number of different strategies have been suggested for addressing this problem, which commonly involve reducing the search space, aggregating the data or simplifying the representations often at the cost of information loss or distortion of spatial context. We propose an interactive approach for exploring large and highly connected networks of flows without distorting the geographical space and without losing the context overview in the process. The approach is based on a flow-specific interaction technique for filtering the data by direction, that enables an analyst to successively identify underlying spatial arrangement patterns. We illustrate our approach through exploring flows of tourists and locals in the Greater London area

Биодеградация полигидроксиалканоатов в природных водных экосистемах

The review reports studies of PHA biodegradation behavior in natural freshwater and marine environments. The factors determining polymer degradation rates in water basin include the temperature and the mineral component of the water, the structure of the aquatic ecosystem and bacterioplankton composition. Anaerobic degradation occurs at slower rates as compared with aerobic process. One of the factors limiting PHA degradation rates is deficiency of dissolved mineral phosphorus, which hinders the development of microbial components of the ecosystem. Differences in biodegradation patterns of PHA specimens are accounted for by different structures and surface areas of specimens, which influence the adhesion of microorganisms. Bacteria are main PHA destructors in water ecosystems as opposed to soil environments where micromycetes are most significant degradersВ обзоре приведены результаты исследований по биодеградации полигидроксиалканоатов (ПГА) в природных пресноводных и морских экосистемах. Факторы, определяющие скорости деградации полимеров в условиях водоема, включают температуру и минеральный состав воды, структуру водной экосистемы и состав бактериопланктона. При наличии в водоеме аэробной и анаэробной зон анаэробная деградация протекает с меньшими скоростями по сравнению с аэробной. Одним из факторов, ограничивающих скорости деградации ПГА, является недостаток растворенного минерального фосфора, препятствующий развитию микробных сообществ экосистемы. Отличия в особенностях биодеградации ПГА обусловлены также различными структурой и поверхностью образцов, влияющими на адгезию микроорганизмов. Бактерии являются основными деструкторами ПГА в водных экосистемах, в отличие от почвенных, где наибольшее значение имеют микромицет

Microbial Degradation of Polyhydroxyalkanoates in Fresh Tropical Water

Исследованы закономерности биодеградации образцов полигидроксиалканоатов (ПГА) различной химической структуры и морфологии в пресных тропических водоёмах Южного Вьетнама (г. Нячанг) – в искусственом бессточном бассейне и проточной воде реки Кай. Выявлено, что профили снижения массы плёнок и прессованных форм в реке Кай не зависели от химической структуры полимеров, образцы гомополимера 3-гидроксибутирата и сополимера 3-гидроксибутирата и 3-гидроксивалерата разрушались с одинаковой интенсивностью. В искусственном водоёме быстрее происходило разрушение образцов из гомополимера. Изучение таксономического разнообразия микроорганизмов в биоплёнках обрастания на поверхности образцов полимеров выявило различия в сообществах доминантных микроорганизмов- деструкторов. Доля бактерий-деструкторов, обладающих ПГА-деполимеразами, среди прочих органотрофов была выше в реке Кай, составляя от 7 до 17 % на разных образцах, однако таксономический состав бактерий деструкторов был менее разнообразным. В реке Кай сообщество деструкторов было представлено бактериями родов Bacillus, Acinetobacter и Streptomyces, а в искусственном водоёме – представителями родов Bacillus, Pseudomonas, Corynebacterium, Mycobacterium, а также актинобактериями. Микромицеты-деструкторы были обнаружены только в искусственном водоёме – Aspergillus candidus и Verticillium albaThe biodegradation patterns of different polyhydroxyalkanoates (PHAs) was studied in freshwater tropical reservoirs of South Vietnam (Nha Trang), in an artificial still water reservoir and in running water of the River Kai. It was revealed the weight loss profiles of films and pellets in the River Kai did not depend on the chemical structure of the polymer samples; poly(3-hydroxybutyrate) and a copolymer of poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyvalerate) degraded with the same intensity. The weight loss of homopolymer samples was faster in artificial reservoir. The study of the taxonomic variety of microorganisms in the fouling films of polymer samples showed differences in the dominant communities of PHA-degrading microorganisms. Among other organotrophs the proportion of PHAdepolymerase synthesizing bacteria was higher in the River Kai and ranging from 7 to 17 % in different samples, in spite of that the taxonomic variety of PHA-degrading bacteria was less diverse. The PHAdegrading community of the River Kai was represented by Bacillus, Acinetobacter and Streptomyces, from artificial reservoir samples Bacillus, Pseudomonas, Corynebacterium, Mycobacterium and Actinobacteria was isolated. The PHA-degrading fungi – Aspergillus candidus and Verticillium alba – were found only in the artificial reservoi

Biodegradation Behavior of Polyhydroxyalkanoates on the Territory of Vietnam and Central Siberia

Изучена биодеградация полигидроксиалканоатов (ПГА) в экосистемах, расположенных в различных регионах и климатических условиях, и установлено, что периоды, в течение которых масса полимера падает на ½ от исходной, могут существенно варьировать в зависимости от численности, видовой принадлежности и физиологической активности микроорганизмов, определяемой характеристикой природной среды, прежде всего температурным режимом и влажностью почвы. Характер биоразрушения также зависит от состава ПГА (сополимерные образцы разрушаются быстрее в сибирских почвах, гомополимерные - в тропических), метода получения и формы полимерного изделия (двумерные формы разрушаются активнее объемных прессованных). Отличия видового состава идентифицированных ключевых микроорганизмов- деструкторов объясняют выявленные особенности биоразрушения ПГА в различных экосистемах.For the first time, PHA biodegradation was studied in microecosystems situated in different regions and under different climate conditions. The study showed that the time necessary for the polymer weight to decrease to a half of its initial weight, could vary significantly, depending on the number, species composition, and physiological activity of microbial communities which are determined, in particular, by the specific properties of the natural environment, temperature conditions and soil moisture. Biodegradation behavior also depends on PHA composition (PHA copolymers are degraded faster in Siberian soils while homopolymers are degraded at a higher rate in the tropical soils), production method, and the shape of the polymer device (2D specimens are degraded faster than 3D pressed ones). Differences in the species composition of the identified major PHA degrading microorganisms account for the particular PHA biodegradation behavior in different ecosystems

Биодеградация полигидроксиалканоатов в природных водных экосистемах

The review reports studies of PHA biodegradation behavior in natural freshwater and marine environments. The factors determining polymer degradation rates in water basin include the temperature and the mineral component of the water, the structure of the aquatic ecosystem and bacterioplankton composition. Anaerobic degradation occurs at slower rates as compared with aerobic process. One of the factors limiting PHA degradation rates is deficiency of dissolved mineral phosphorus, which hinders the development of microbial components of the ecosystem. Differences in biodegradation patterns of PHA specimens are accounted for by different structures and surface areas of specimens, which influence the adhesion of microorganisms. Bacteria are main PHA destructors in water ecosystems as opposed to soil environments where micromycetes are most significant degradersВ обзоре приведены результаты исследований по биодеградации полигидроксиалканоатов (ПГА) в природных пресноводных и морских экосистемах. Факторы, определяющие скорости деградации полимеров в условиях водоема, включают температуру и минеральный состав воды, структуру водной экосистемы и состав бактериопланктона. При наличии в водоеме аэробной и анаэробной зон анаэробная деградация протекает с меньшими скоростями по сравнению с аэробной. Одним из факторов, ограничивающих скорости деградации ПГА, является недостаток растворенного минерального фосфора, препятствующий развитию микробных сообществ экосистемы. Отличия в особенностях биодеградации ПГА обусловлены также различными структурой и поверхностью образцов, влияющими на адгезию микроорганизмов. Бактерии являются основными деструкторами ПГА в водных экосистемах, в отличие от почвенных, где наибольшее значение имеют микромицет

Biodegradation Behavior of Polyhydroxyalkanoates on the Territory of Vietnam and Central Siberia

Изучена биодеградация полигидроксиалканоатов (ПГА) в экосистемах, расположенных в различных регионах и климатических условиях, и установлено, что периоды, в течение которых масса полимера падает на ½ от исходной, могут существенно варьировать в зависимости от численности, видовой принадлежности и физиологической активности микроорганизмов, определяемой характеристикой природной среды, прежде всего температурным режимом и влажностью почвы. Характер биоразрушения также зависит от состава ПГА (сополимерные образцы разрушаются быстрее в сибирских почвах, гомополимерные - в тропических), метода получения и формы полимерного изделия (двумерные формы разрушаются активнее объемных прессованных). Отличия видового состава идентифицированных ключевых микроорганизмов- деструкторов объясняют выявленные особенности биоразрушения ПГА в различных экосистемах.For the first time, PHA biodegradation was studied in microecosystems situated in different regions and under different climate conditions. The study showed that the time necessary for the polymer weight to decrease to a half of its initial weight, could vary significantly, depending on the number, species composition, and physiological activity of microbial communities which are determined, in particular, by the specific properties of the natural environment, temperature conditions and soil moisture. Biodegradation behavior also depends on PHA composition (PHA copolymers are degraded faster in Siberian soils while homopolymers are degraded at a higher rate in the tropical soils), production method, and the shape of the polymer device (2D specimens are degraded faster than 3D pressed ones). Differences in the species composition of the identified major PHA degrading microorganisms account for the particular PHA biodegradation behavior in different ecosystems